MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ATCC BAA-894 plasmid pESA2

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009779	GAAA	2	8	99	106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009779	G	6	6	186	191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009779	GCC	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009779	G	6	6	252	257	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009779	AGC	2	6	342	347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009779	TTC	2	6	721	726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009779	TA	3	6	3261	3266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009779	TA	3	6	3769	3774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009779	GCAT	2	8	4171	4178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009779	CCT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009779	ATTAT	2	10	4455	4464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009779	C	6	6	5123	5128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_009779	TA	3	6	5129	5134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009779	TA	3	6	5181	5186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009779	AGG	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009779	TAT	2	6	5505	5510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009779	TGA	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009779	TTC	2	6	7817	7822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009779	TA	3	6	7923	7928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009779	A	8	8	7962	7969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009779	GAAC	2	8	7970	7977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009779	TA	4	8	7998	8005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009779	TCGT	2	8	8170	8177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009779	A	6	6	8179	8184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009779	G	6	6	8185	8190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009779	AAC	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009779	CAG	2	6	8358	8363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009779	CG	3	6	8396	8401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009779	ACCC	2	8	8481	8488	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009779	GTC	2	6	8509	8514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009779	GGC	2	6	10353	10358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009779	AGG	2	6	10442	10447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009779	AGC	2	6	10463	10468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009779	GAT	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009779	AGAAT	2	10	11615	11624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009779	AAG	3	9	11712	11720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009779	GAC	2	6	14720	14725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009779	CT	3	6	15324	15329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009779	AAG	2	6	15330	15335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009779	AC	3	6	15362	15367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009779	TA	3	6	15386	15391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009779	TGAC	2	8	15425	15432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009779	TAA	2	6	15455	15460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009779	GTG	2	6	16442	16447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009779	CGA	2	6	16531	16536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009779	ATCC	2	8	16576	16583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009779	CCG	2	6	16777	16782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009779	CGG	2	6	16810	16815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009779	T	7	7	16923	16929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009779	GTAA	2	8	16947	16954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009779	TTAC	2	8	17005	17012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009779	GTT	2	6	17109	17114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009779	T	6	6	17113	17118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009779	ACG	3	9	17785	17793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009779	TCAC	2	8	17876	17883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009779	TGA	2	6	17999	18004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009779	G	6	6	18013	18018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009779	CCGT	2	8	18105	18112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009779	CATTA	2	10	18125	18134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009779	ATC	2	6	18178	18183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009779	ATT	2	6	18212	18217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009779	GTT	2	6	18248	18253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009779	T	6	6	18285	18290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009779	AAGCG	2	10	18313	18322	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009779	GGCA	2	8	18324	18331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009779	ACCC	2	8	18703	18710	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_009779	TTA	2	6	18795	18800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009779	AC	3	6	18823	18828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009779	ACT	2	6	18833	18838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009779	CGG	2	6	18908	18913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009779	GGA	2	6	18938	18943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009779	CCG	2	6	19424	19429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009779	AGC	2	6	19437	19442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009779	T	7	7	19447	19453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009779	CT	3	6	23680	23685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009779	T	7	7	23708	23714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009779	CT	3	6	25717	25722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009779	A	6	6	25770	25775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009779	AT	3	6	27521	27526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009779	TA	3	6	27536	27541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009779	AAC	2	6	30612	30617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009779	TAA	2	6	30625	30630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009779	TCA	2	6	30666	30671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009779	CCA	2	6	30700	30705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_009779	TAAT	2	8	30718	30725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009779	ATC	2	6	30739	30744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009779	T	6	6	30815	30820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009779	CGC	2	6	30838	30843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009779	A	6	6	30871	30876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.